Arbetsbeskrivning

Vill du arbeta med molekylär evolution, med stöd av kompetenta och trevliga kollegor i en internationell miljö? Vill du ha en arbetsgivare som satsar på ett hållbart medarbetarskap och erbjuder trygga, förmånliga arbetsvillkor? Välkommen att söka anställning som doktorand på Uppsala universitet. Institutionen för cell- och molekylärbiologi är indelad i sju forskningsprogram som vart och ett fokuserar på olika områden inom cell- och molekylärbiologi: beräkningsbiologi och bioinformatik, mikrobiologi och immunologi, molekylärbiologi, molekylär biofysik, molekylär evolution, molekylär systembiologi och strukturbiologi. Den vetenskapliga grunden för det vi gör ligger inom biologin, men vår forskning överlappar med andra områden som medicin, datavetenskap, matematik, kemi, ingenjörsvetenskap och fysik. Institutionen har över 200 anställda, varav runt 60 doktorander. Läs gärna mer om vårt arbete på https://icm.uu.se.  En doktorandtjänst i Jennifer James forskargrupp på programmet för Molekylär Evolution är nu tillgänglig. Mer information om hennes forskning finns här: https://www.scilifelab.se/researchers/jennifer-james/. Tjänsten är fullt finansierad under fyra år. Den sökande kommer att bli medlem i en nyetablerad forskargrupp som fokuserar på att förstå de evolutionära mönster och processer som formar genom och proteom. Vi är glada att välkomna dig till gruppen! Projektbeskrivning Att förstå den mutationsvariation som finns i populationer är ett centralt mål inom evolutionär biologi. Mängden och typen av stående variation inom genomet avgör hur väl populationer kan anpassa sig och hur mottagliga de är för att bära på något skadliga mutationer. Mycket av nuvarande analys fokuserar dock endast på en typ av mutation, känd som SNP, som endast påverkar enstaka nukleotider. Målet med detta doktorandprojekt är att undersöka effekten av andra typer av mutationer på populationers fitness, med särskilt fokus på kopietalsvariation (CNV), det vill säga genomiska regioner av medelstor storlek som finns i varierande antal kopior hos individer i en population. Detta projekt kommer att utforska evolutionära mönster i understuderade kategorier av mutationer för att bedöma deras effekter inom och mellan arter, för att förstå hur de förändras i kopietal inom ett genom och för att undersöka deras potentiella roll i anpassningen. Arbetsuppgifter Denna doktorandtjänst kommer att vara helt databaserad, med fokus på storskalig bioinformatisk analys av befintliga data från en rad olika arter. Doktoranden kommer att ansvara för att skapa en bioinformatisk pipeline för att analysera genomiska data, för att tillämpa banbrytande metoder för att identifiera och karakterisera CNV, samt för att beräkna sammanfattande populationsgenetisk statistik. Studenten kommer sedan att genomföra jämförande genomiska analyser för att bedöma de sannolika effekterna av olika typer av mutationer på fitness. Studenten kommer också att utforska hur CNV kan öka eller minska i kopietal över evolutionär tid inom ett genom. Slutligen kommer studenten att undersöka hur man kan förutsäga de effekter som understuderade mutationskategorier har på fitness. Ytterligare specifika forskningsprojekt kommer att utvecklas i samarbete med kandidaten, beroende på hens projektresultat och forskningsintressen. Kvalifikationskrav Behörig till utbildning på forskarnivå är den som har     -    avlagt examen på avancerad nivå inom biologi, eller     -    fullgjort minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå inklusive ett självständigt arbete om minst 15 högskolepoäng, eller     -    på något annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper. Önskvärt/meriterande i övrigt Tidigare erfarenhet inom beräkningsbiologi, bioinformatik eller generellt inom programmering är meriterande. Erfarenhet av arbete inom populationsgenetik och evolutionsbiologi/genomik eller proteomik är också meriterande. Erfarenhet av matematisk modellering och statistik är meriterande. Bestämmelser för doktorander återfinns i Högskoleförordningen 5 kap §§ 1-7 samt i https://uu.varbi.com/center/tool/position/900807/edit/tab:2/uu.se/medarbetare/organisation-styrning/regler/?languageId=3 Om anställningen Anställningen är tidsbegränsad, enligt HF 5 kap § 7. Omfattningen är heltid. Tillträde 2026-05-04 eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala  Upplysningar om anställningen lämnas av: Jennifer James, [email protected]. Välkommen med din ansökan senast den 2026-03-02, UFV-PA 2026/365. Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 600 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/ Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd. Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem. Fackliga företrädare: Saco-S - [email protected], Seko - [email protected], ST (OFR/S) - [email protected]